Allophycocyanin Inibidores

Os inibidores comuns da aloficocianina incluem, entre outros, o sulfato de cobre(II) CAS 7758-98-7, a clorpromazina CAS 50-53-3, a N-etilmaleimida CAS 128-53-0, o cloridrato de guanidina CAS 50-01-1 e a ureia CAS 57-13-6.

Os inibidores da aloficocianina são um conjunto diversificado de substâncias químicas que modulam a estrutura e a função da proteína de várias formas. Podem ser amplamente categorizados com base no seu modo de ação. Substâncias químicas como o Sulfato de Cobre e o Sulfato de Zinco ligam-se diretamente à proteína, afectando a sua estrutura terciária e comprometendo assim a sua capacidade de captar eficazmente a energia luminosa. Um outro conjunto de produtos químicos, como a clorpromazina, actua no ambiente membranar, especificamente na membrana tilacoide, onde a aloficocianina se encontra incorporada. Ao alterarem a integridade da membrana, estes químicos causam instabilidade ou dissociação da proteína. Isto é semelhante ao que o tolueno faz, embora através de um mecanismo diferente. O tolueno afecta a composição lipídica da membrana, o que consequentemente afecta a localização e a estabilidade da aloficocianina nos ficobilissomas.

Os desnaturantes, como o cloridrato de guanidina e a ureia, actuam desdobrando a proteína e prejudicando a sua funcionalidade. De forma semelhante, o Ditiotreitol (DTT) reduz as ligações dissulfureto dentro da proteína, fazendo com que esta se dissocie nas suas subunidades individuais, incapacitando-a efetivamente. Substâncias químicas como a N-Etilmaleimida e a Formamida actuam em grupos químicos específicos da aloficocianina. Por exemplo, a N-Etilmaleimida reage com grupos sulfidrilo, levando a modificações que fazem com que a proteína perca a sua estrutura e funcionalidade. Por outro lado, a formamida desnatura a aloficocianina ao romper as ligações de hidrogénio que são essenciais para a sua estrutura. Detergentes como o Dodecil Sulfato de Sódio solubilizam a proteína, removendo-a do seu ambiente nativo e tornando-a assim não funcional. O etanol actua solubilizando as bicamadas lipídicas, fazendo com que a aloficocianina se dissocie dos ficobilissomas, enquanto o cloreto de sódio em concentrações elevadas induz stress iónico, desestabilizando ainda mais a proteína.