Os produtos químicos classificados como inibidores da TRAPPC13 não têm como alvo direto a TRAPPC13, mas podem influenciar os processos e vias celulares nos quais a TRAPPC13 está implicada. Este complexo está envolvido no tráfico vesicular, particularmente na via secretora, que inclui o transporte de proteínas do retículo endoplasmático através do aparelho de Golgi para os seus destinos finais. Compostos como a Wortmannin e a Brefeldin A perturbam a sinalização a montante e a função do aparelho de Golgi, respetivamente, o que pode afetar indiretamente as etapas de tráfico facilitadas pela TRAPPC13. Do mesmo modo, substâncias químicas como o Dynasore e a Cytochalasin D inibem componentes celulares como as dinaminas e a actina, respetivamente, que desempenham um papel crucial na mecânica do movimento e da cisão das vesículas, processos que são essenciais para o tráfico vesicular adequado.
Além disso, a integridade do citoesqueleto é vital para o transporte de vesículas dentro das células. Agentes como o Paclitaxel e o Nocodazole afectam a estabilidade dos microtúbulos, influenciando assim potencialmente o papel da TRAPPC13 no tráfico. Outros compostos, como o ML141 e o NSC23766, têm como alvo pequenas GTPases como a Cdc42 e a Rac1, que são fundamentais para a regulação da dinâmica do citoesqueleto e do tráfico de vesículas. Estas pequenas GTPases são essenciais para manter a direccionalidade e a especificidade do transporte de vesículas, um processo do qual se acredita que a TRAPPC13 faz parte.
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