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Six1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402063-ACT | 20 µg | $397.00 |
SIX1は、器官形成、筋形成、感覚プラコード形成などを含む胚発生プログラムを、系譜特異的な遺伝子発現ネットワークを協調的に制御することで調節するホメオボックス型転写因子Six1をコードする。Six1は、WNT、FGF、TGF-βなどの発生シグナル伝達経路と連携する転写制御回路の中で機能し、細胞運命決定、増殖、分化を形作る。成人組織では、SIX1発現の異常な制御により、上皮間葉転換(EMT)、浸潤関連プログラム、細胞周期制御の変化に結び付いた逸脱した転写状態が促進され得る。その結果、SIX1は、がん生物学における発生遺伝子の再活性化を駆動する因子、ならびに組織特異的な分化表現型を規定する決定因子として広く研究されている。
Six1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SIX1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Six1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SIX1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSIX1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Six1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSIX1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるSix1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSIX1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるSix1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。