SFXN2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-414132

Panoramica

SFXN2 (sideroflexin 2) è un trasportatore della membrana interna mitocondriale implicato nel mantenimento dell’omeostasi metabolica mitocondriale e nel supporto dei processi legati alla fosforilazione ossidativa. In quanto membro della famiglia delle sideroflexine, è associato a funzioni di trasporto che influenzano il metabolismo a un carbonio, l’utilizzo degli amminoacidi e l’equilibrio redox, incidendo così sulla respirazione mitocondriale e sulla gestione delle specie reattive dell’ossigeno. Alterazioni del trasporto mitocondriale e dello stato bioenergetico possono modulare la segnalazione da stress, le vie dell’immunità innata e le decisioni sul destino cellulare. Di conseguenza, SFXN2 è di interesse in ambiti di ricerca che collegano la disfunzione mitocondriale a fenotipi cardiometabolici e legati alla neurodegenerazione, oltre che al rimodellamento metabolico delle cellule tumorali.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SFXN2 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SFXN2 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SFXN2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SFXN2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SFXN2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SFXN2 per lo studio della segnalazione di SFXN2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SFXN2 critici per la funzione di SFXN2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SFXN2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SFXN2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SFXN2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SFXN2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SFXN2 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SFXN2 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SFXN2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SFXN2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.