SETMAR Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-417901

Panoramica

SETMAR (nota anche come Metnase) è una metiltransferasi umana della lisina contenente un dominio SET, fusa con un dominio derivato da una trasposasi mariner, che coordina la modifica della cromatina con l’elaborazione delle estremità del DNA. Partecipa alla riparazione delle rotture a doppio filamento del DNA e al mantenimento del genoma modulando la giunzione delle estremità non omologhe (NHEJ) e influenzando le risposte allo stress associato alla replicazione. Attraverso interazioni con fattori di riparazione e componenti della cromatina, SETMAR può influenzare la regolazione trascrizionale e l’accessibilità della cromatina nei siti di danno. Un’attività o un’espressione deregolate di SETMAR sono state associate a una capacità di riparazione del DNA alterata e a instabilità genomica, rendendola rilevante per studi di biologia del cancro, radiosensibilità e meccanismi di risposta ai farmaci.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SETMAR (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SETMAR in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SETMAR insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SETMAR a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SETMAR.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SETMAR per lo studio della segnalazione di SETMAR, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SETMAR critici per la funzione di SETMAR
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SETMAR per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SETMAR CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SETMAR CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SETMAR. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SETMAR Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SETMAR (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SETMAR per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SETMAR definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.