CTR9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-423522

Übersicht

Das Mausgen **Ctr9** kodiert **CTR9**, eine zentrale Untereinheit des **Polymerase-Associated Factor 1 Complex** (**PAF1C**), der die Transkriptionselongation der RNA-Polymerase II mit der Chromatinregulation koordiniert. CTR9 unterstützt transkriptionsgekoppelte Histonmodifikationen wie die Methylierung von H3K4 und H3K36 und beeinflusst dadurch das promotornahe Pausieren, die mRNA-Prozessierung sowie die Aufrechterhaltung zellulärer Identitätsprogramme. Über diese Funktionen wirkt CTR9 auf Signalwege ein, die Proliferation, Differenzierung und Genomstabilität steuern; eine veränderte PAF1C-Aktivität wurde zudem mit fehlregulierten Transkriptionsnetzwerken in Verbindung gebracht, die für die Krebsbiologie und Entwicklungsphänotypen relevant sind. Eine Störung von **Ctr9** bietet daher einen gut handhabbaren Ansatzpunkt, um die epigenetische Kontrolle der Genexpression und die transkriptionelle Homöostase in Säugerzellen zu untersuchen.

Das CTR9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Ctr9-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Ctr9-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Ctr9 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die CTR9-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Ctr9-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der CTR9-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Ctr9-Exone abzielen, die für die CTR9-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Ctr9-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom CTR9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom CTR9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Ctr9-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das CTR9 HDR-Plasmid (m) und CTR9 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Ctr9-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Ctr9-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.