Cdx1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-402522

Panoramica

CDX1 codifica il fattore di trascrizione homeobox di tipo caudale Cdx1, un regolatore che si lega al DNA in modo sequenza-specifico e contribuisce a definire l’asse antero-posteriore, sostenendo al contempo la differenziazione dell’epitelio intestinale. Cdx1 opera all’interno di programmi trascrizionali guidati da homeobox e interagisce con vie di segnalazione come Wnt/β-catenina, che modellano lo sviluppo dell’intestino, le decisioni di destino cellulare e l’identità regionale. Un’alterata espressione di CDX1 è stata riportata in contesti di patologie gastrointestinali, inclusa la biologia dei tumori colorettali, dove la differenziazione deregolata e la segnalazione proliferativa aberrante sono caratteristiche comuni. In quanto fattore di trascrizione associato a una linea cellulare, CDX1 è spesso utilizzato per studiare i meccanismi di maturazione epiteliale, programmi genici di tipo metaplastico e il rimodellamento delle reti trascrizionali.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Cdx1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CDX1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CDX1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CDX1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Cdx1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CDX1 per lo studio della segnalazione di Cdx1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni CDX1 critici per la funzione di Cdx1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CDX1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Cdx1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Cdx1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CDX1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Cdx1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Cdx1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CDX1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CDX1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.