AKR1A1 Plasmide di attivazione CRISPR (h): sc-416233-ACT

AKR1A1 (aldo-keto reduttasi famiglia 1, membro A1) codifica un’ossidoreduttasi NADPH-dipendente che catalizza la riduzione di aldeidi reattive e di substrati contenenti gruppi carbonilici, contribuendo alla detossificazione cellulare e all’omeostasi redox. La proteina partecipa al metabolismo delle aldeidi e interagisce con i sistemi di difesa dipendenti dal glutatione limitando l’accumulo di prodotti citotossici della perossidazione lipidica. Attraverso la modulazione dello stress da carbonili e dell’utilizzo di NADPH, AKR1A1 influenza le risposte allo stress ossidativo, la funzione mitocondriale e l’adattamento metabolico. Un’attività deregolata di AKR1A1 è stata associata ad alterazioni nella gestione degli xenobiotici e a fenotipi di stress cellulare rilevanti per i disturbi metabolici, l’infiammazione e la biologia del cancro.

AKR1A1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di AKR1A1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.

AKR1A1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus AKR1A1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.

Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione AKR1A1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di AKR1A1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus AKR1A1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da AKR1A1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via AKR1A1 nelle cellule tumorali con espressione di AKR1A1 silenziata o ridotta.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.