UBF CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-400521

개요

UBTF는 상류 결합 전사인자(upstream binding transcription factor, UBF)를 암호화하며, UBF는 리보솜 DNA(rDNA)의 RNA 중합효소 I(Pol I) 의존적 전사에 필수적인 고이동성군(HMG) 박스 DNA 결합 단백질입니다. UBF는 rDNA 염색질의 조직화를 돕고 Pol I 전사 개시 전(preinitiation) 복합체의 형성을 촉진하며, 인(nucleolus)의 구조와 리보솜 생합성을 지지함으로써 세포 성장 조절과 단백질 항상성(proteostasis)과의 연계를 갖습니다. 또한 인 스트레스(nucleolar stress) 신호전달에서의 역할과 세포주기 및 DNA 손상 반응 경로와의 조율을 통해, UBTF/UBF 활성의 변화는 증식과 유전체 안정성에 영향을 줄 수 있습니다. Pol I 전사와 인 기능의 이상 조절은 암 생물학에서 반복적으로 관찰되는 특징이며, 신경발달 및 신경퇴행성 질환 맥락에서도 관련성이 제기되어 왔습니다.

UBF CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 UBTF 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 UBTF 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 UBTF의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 UBF 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 UBF 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 UBTF 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• UBF 기능에 중요한 UBTF 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 UBTF 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• UBF CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 UBF CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 UBTF 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  UBF HDR 플라스미드 (h) 및 UBF HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 UBTF 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 UBTF 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.