TIF1γ CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403230

概要

TRIM33は、クロマチン依存的な遺伝子制御とシグナル伝達を統合する、三者モチーフ（TRIM）ファミリーに属する転写制御因子兼E3ユビキチンリガーゼであるTIF1γをコードする。TIF1γはSMAD4の利用可能性を調節することでTGF-β/SMADシグナル伝達を制御し、コリプレッサーやエピジェネティック機構との相互作用を通じて系譜特異的な転写プログラムにも影響を与える。また、ゲノム安定性の維持やDNA損傷応答にも関与し、転写制御と細胞ストレス経路を結び付けている。TRIM33活性の破綻は、分化の異常や腫瘍性シグナル伝達の文脈と関連づけられており、がん生物学および発生制御の機構研究において重要である。

TIF1γ CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるTRIM33遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、TRIM33内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、TRIM33のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TIF1γタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TIF1γシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、TRIM33欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TIF1γの機能に不可欠なTRIM33エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、TRIM33ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TIF1γ CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびTIF1γ CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、TRIM33遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TIF1γ HDRプラスミド（h）および TIF1γ HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTRIM33ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTRIM33標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。