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TARDBPCRISPR激活质粒(h) | sc-401890-ACT | 20 µg | $397.00 |
TARDBP 编码 TDP-43,这是一种 RNA/DNA 结合蛋白,调控前体 mRNA(pre-mRNA)的剪接、mRNA 稳定性与转运,在神经元 RNA 代谢以及应激颗粒动力学中具有重要作用。TDP-43 通过结合富含 UG 的 RNA 基序,调节可变剪接程序并维持转录组完整性,因此与调控蛋白稳态、核质转运和细胞应激反应等通路相关联。TDP-43 的定位异常与聚集是多种神经退行性疾病的标志性特征,而 TARDBP 依赖的剪接改变也被认为参与了与疾病相关的基因网络。因此,TARDBP 常被用于在人类细胞模型中研究 RNA 加工机制、神经毒性以及基因表达调控。
TARDBP CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性TARDBP的表达。
TARDBP CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的TARDBP基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于TARDBP转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性TARDBP表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的TARDBP位点,并能够研究内源性位点上依赖于TARDBP的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在TARDBP表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟TARDBP通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。