Sox-21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406354

概要

SOX21は転写因子Sox-21をコードしており、Sox-21は高移動度群（HMG）ボックスをもつDNA結合タンパク質として、外胚葉系および神経組織における系譜決定と分化プログラムを制御する。Sox-21はNotchおよびWntシグナル伝達と交差する転写ネットワークに関与し、状況依存的な遺伝子の抑制または活性化を通じて、前駆細胞の維持とニューロン成熟のバランスを調節し得る。発生過程では細胞運命の規定や組織パターニングに寄与するため、神経新生および表皮分化の転写制御を研究する上で有用な結節点となる。SOX21発現の異常は複数の腫瘍タイプや異常な分化状態で報告されており、発がん性転写プログラムや細胞状態遷移における役割の解明が支持されている。

Sox-21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSOX21遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SOX21内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SOX21のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sox-21タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sox-21シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SOX21欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sox-21の機能に不可欠なSOX21エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SOX21ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sox-21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSox-21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SOX21遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sox-21 HDRプラスミド（h）および Sox-21 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSOX21ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSOX21標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。