Rent3b CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-406904

개요

UPF3B는 조기 종결 코돈(premature termination codon)을 포함한 mRNA를 제거하고 생리적 전사체의 일부를 조절함으로써 전사체(트랜스크립톰) 무결성을 보호하는 무의미 매개 mRNA 분해(nonsense-mediated mRNA decay, NMD) 기계의 핵심 구성요소인 Rent3b를 암호화합니다. Rent3b는 엑손 접합 복합체(exon junction complex, EJC) 연관 감시(surveillance)와 결합하며, UPF2 및 UPF1 같은 NMD 인자들과 상호작용해 번역 종결을 표적 RNA 분해와 연결합니다. 이러한 기능을 통해 UPF3B는 RNA 품질 관리, 유전자 발현 항상성, 그리고 비정상적인 mRNA 처리와 연관된 세포 스트레스 반응에 영향을 미칩니다. UPF3B 의존적 NMD의 장애는 신경발달성 표현형 및 신경계 질환을 비롯한 RNA 대사 관련 질환과 연관된 발현 프로그램 변화와 연결되어 왔습니다.

Rent3b CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 UPF3B 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 UPF3B 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 UPF3B의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 Rent3b 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 Rent3b 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 UPF3B 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• Rent3b 기능에 중요한 UPF3B 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 UPF3B 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• Rent3b CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 Rent3b CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 UPF3B 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  Rent3b HDR 플라스미드 (h) 및 Rent3b HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 UPF3B 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 UPF3B 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.