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Ref-1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-400932-ACT | 20 µg | $397.00 |
APEX1はRef-1(APE1)をコードしており、酸化損傷、アルキル化、あるいは自発的な塩基脱離の後に生じるアバシック(AP)DNA部位を切断することで塩基除去修復(BER)を統括する、必須の脱プリン/脱ピリミジンエンドヌクレアーゼです。DNA修復にとどまらず、Ref-1は酸化還元(レドックス)制御因子としても働き、AP-1、NF-κB、HIF-1など、ストレス応答や炎症性シグナル伝達に関与する転写因子のDNA結合活性を調節します。これらの作用を通じて、APEX1はゲノム安定性、複製に伴う損傷への耐性、ならびに活性酸素種(ROS)に対する細胞応答を支えます。APEX1活性の異常やレドックス/修復バランスの変化は、腫瘍生物学、神経変性、炎症性病態と関連づけられており、DNA損傷応答の機構研究における重要な結節点となっています。
Ref-1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性APEX1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Ref-1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における APEX1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はAPEX1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Ref-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のAPEX1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるRef-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびAPEX1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるRef-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。