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RAPGEF6 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403816-ACT | 20 µg | $397.00 |
RAPGEF6(別名:PDZ-GEF2)は、Rapに特異的なグアニンヌクレオチド交換因子(GEF)をコードしており、RAP1およびRAP2 GTPアーゼを活性化することで、インテグリンのインサイドアウトシグナル伝達、細胞骨格リモデリング、ならびに細胞間接着部位(ジャンクション)の動態を協調的に制御します。Rap依存性経路の調節を通じて、RAPGEF6は多様な組織環境における細胞接着、移動、極性の制御に寄与します。また、その活性は、MAPKや低分子GTPアーゼの回路に影響する受容体下流のシグナルネットワークと連関し、輸送(トラフィッキング)および膜近傍のシグナル伝達の在り方を形作ります。RAPGEF6に関連するRapシグナルと接着プログラムの破綻は、浸潤性の細胞挙動、免疫細胞のトラフィッキング、その他の疾患に関連した組織構築の変化を扱う研究において重要です。
RAPGEF6 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性RAPGEF6の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
RAPGEF6 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における RAPGEF6 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はRAPGEF6転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性RAPGEF6の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のRAPGEF6遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるRAPGEF6依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびRAPGEF6発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるRAPGEF6経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。