PTPN21 Double Nickase Plasmid (h): sc-407466-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das PTPN21 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- PTPN21 Double-Nickase-Plasmid (h) und PTPN21 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf PTPN21 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
PTPN21 Double Nickase Plasmid (h) | sc-407466-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
PTPN21 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-407466-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
PTPN21 kodiert eine nichtrezeptorische Protein-Tyrosinphosphatase, die die Signaltransduktion moduliert, indem sie Phosphotyrosinreste auf Zielproteinen dephosphoryliert und damit Stärke und Dauer rezeptor- und adhäsionsgekoppelter Signalwege feinabstimmt. Über Interaktionen mit Scaffold- und Endozytosekomponenten wurde PTPN21 mit der Koordination von Zytoskelettumbau, Zellmotilität und Membrantransport in Verbindung gebracht und beeinflusst dabei Prozesse wie die Dynamik fokaler Adhäsionen und den Turnover von Wachstumsfaktorrezeptoren. Aufgrund dieser Verknüpfungen wird PTPN21 häufig in Kontexten untersucht, in denen das Gleichgewicht der Tyrosinphosphorylierung Proliferation, Migration und zelluläre Stressantworten beeinflusst. Eine veränderte Regulation der Phosphataseaktivität und der Tyrosin-Signalnetzwerke unter Beteiligung von PTPN21 wurde mit onkogenen Signalzuständen und anderen Erkrankungen assoziiert, die durch fehlregulierte Zellsignalgebung und Adhäsion gekennzeichnet sind.
PTPN21 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des PTPN21-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von PTPN21 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die PTPN21-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit PTPN21-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.