PPPDE2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406172

概要

PPPDE2（DESI1としても注釈される）は、翻訳後修飾によるタンパク質の安定性やシグナル伝達の調節に関与するとされる、システイン依存性プロテアーゼ／脱ユビキチン化酵素様タンパク質をコードします。報告されている活性には、脱SUMO化やユビキチン様修飾因子のプロセシングが含まれ、PPPDE2はプロテオスタシス、ストレス応答、ならびに核内および細胞質タンパク質機能の動的制御と関連づけられています。これらの機構を通じて、PPPDE2は、可逆的なタンパク質修飾に依存する細胞周期進行、アポトーシス、転写プログラムを制御する経路に影響を及ぼす可能性があります。発現変化や修飾因子ターンオーバーの破綻は、がん生物学や神経変性過程に関連する細胞表現型と結び付けて報告されており、疾患関連モデル系での研究対象として支持されています。

PPPDE2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるDESI1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、DESI1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、DESI1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、PPPDE2タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、PPPDE2シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、DESI1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• PPPDE2の機能に不可欠なDESI1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、DESI1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• PPPDE2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびPPPDE2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、DESI1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  PPPDE2 HDRプラスミド（h）および PPPDE2 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはDESI1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のDESI1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。