PPPDE1 CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-412095

개요

PPPDE1(일부 맥락에서는 DESI2로도 언급됨)은 유비퀴틴 유사(ubiquitin-like) 결합체의 변형을 통해 단백질 안정성과 신호전달의 번역 후(post-translational) 조절에 관여하는, 보존된 탈유비퀴틴화효소/펩티다아제 유사 단백질을 암호화합니다. PPPDE1은 단백질 항상성(proteostasis)과 핵심 조절 단백질의 분해·턴오버에 영향을 줌으로써 스트레스 반응, 세포주기 조절, 막 및 세포질 단백질 품질 관리와 연관된 경로 등 다양한 세포 과정에 영향을 미칠 수 있습니다. PPPDE1 발현의 변화와 유비퀴틴 의존적 신호전달의 이상 조절은 암 및 염증과 관련된 맥락에서 보고된 바 있으며, 이는 PPPDE1이 종양성 신호전달과 세포 항상성에 대한 기전 연구를 위한 중요한 노드로 활용될 수 있음을 뒷받침합니다. PPPDE1의 기능 상실(loss-of-function)을 조사하면 사람 세포에서의 경로 의존성과 하위 기질(downstream substrates)을 규명하는 데 도움이 됩니다.

PPPDE1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 DESI2 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 DESI2 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 DESI2의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 PPPDE1 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 PPPDE1 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 DESI2 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• PPPDE1 기능에 중요한 DESI2 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 DESI2 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• PPPDE1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 PPPDE1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 DESI2 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  PPPDE1 HDR 플라스미드 (h) 및 PPPDE1 HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 DESI2 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 DESI2 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.