OTUD5 CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (m): sc-424913

개요

Otud5는 단백질 기질에서 유비퀴틴 사슬을 제거해 단백질의 안정성과 신호 전달 출력(signaling output)을 조절하는 난소종양(OTU) 계열의 탈유비퀴틴화 효소(deubiquitinase)인 OTUD5를 암호화합니다. OTUD5의 활성은 유비퀴틴 의존적 DNA 손상 반응 조절, 선천면역 신호, 스트레스에 의해 조절되는 전사 프로그램과 맞물려 작동하며, 이를 통해 세포가 체크포인트 활성화와 염증성 신호를 어떻게 조율하는지에 영향을 줍니다. 마우스 모델과 세포 시스템에서 OTUD5 관련 탈유비퀴틴화 과정이 교란되면 단백질 항상성(proteostasis)과 경로 흐름(pathway flux)이 변화할 수 있으며, 이는 신경발달 및 면역 관련 표현형과 연관된 과정들과 연결됩니다. 이러한 특징 때문에 Otud5는 신호 전달과 게놈 무결성을 미세 조정하는 유비퀴틴 편집 메커니즘을 규명하는 데 유용한 표적(노드)입니다.

OTUD5 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (m)는 mouse 세포주에서 Otud5 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 Otud5 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 Otud5의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 OTUD5 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 OTUD5 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 Otud5 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• OTUD5 기능에 중요한 Otud5 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 Otud5 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• OTUD5 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (m) 및 OTUD5 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (m2)에 의해 암호화되는 gRNA는 Otud5 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  OTUD5 HDR 플라스미드 (m) 및 OTUD5 HDR 플라스미드 (m2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 Otud5 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 Otud5 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.