Plasmide CRISPR/Cas9 KO NAP1L3 (h): sc-407403

Présentation

NAP1L3 (nucleosome assembly protein 1-like 3) est un chaperon d’histones de la famille NAP1 impliqué dans l’assemblage et le désassemblage des nucléosomes, soutenant la dynamique de la chromatine lors de la réplication de l’ADN, de la transcription et de la réparation de l’ADN. En modulant le dépôt et l’échange des histones H2A–H2B, NAP1L3 peut influencer la régulation épigénétique, la stabilité du génome et les transitions d’état cellulaire liées aux programmes de différenciation. Des altérations du remodelage de la chromatine et de l’activité des chaperons d’histones sont fréquemment associées à des réseaux transcriptionnels dérégulés observés dans les cancers et les troubles du développement, faisant de NAP1L3 un nœud pertinent pour des études mécanistiques. L’étude de la fonction de NAP1L3 peut aider à préciser comment les voies d’assemblage de la chromatine s’articulent avec les réponses au stress de réplication et le contrôle transcriptionnel.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO NAP1L3 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène NAP1L3 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du NAP1L3, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert NAP1L3 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine NAP1L3.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en NAP1L3 pour l'étude de la signalisation de NAP1L3, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de NAP1L3 essentiels à la fonction de NAP1L3
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de NAP1L3 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le NAP1L3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le NAP1L3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus NAP1L3. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le NAP1L3 plasmide HDR (h) et le NAP1L3 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie NAP1L3 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles NAP1L3 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.