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hnRNP E1CRISPR激活质粒(h) | sc-401557-ACT | 20 µg | $397.00 |
PCBP1 编码异质核核糖核蛋白 E1(hnRNP E1),这是一种可结合 RNA 和 DNA 的因子,通过调控 mRNA 稳定性、可变剪接、转运与翻译来协调转录后基因调控。hnRNP E1 可识别靶转录本中的富含 C 的序列元件,并参与核糖核蛋白复合体,将信号输入与受控的蛋白质合成相耦联。通过这些作用,PCBP1 参与细胞分化、应激反应以及维持蛋白质组稳态等过程。PCBP1/hnRNP E1 的表达或功能异常与癌症生物学及其他与 RNA 加工异常相关疾病中观察到的基因表达程序失调有关。
hnRNP E1 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性PCBP1的表达。
hnRNP E1 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的PCBP1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于PCBP1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性hnRNP E1表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的PCBP1位点,并能够研究内源性位点上依赖于hnRNP E1的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在PCBP1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟hnRNP E1通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。