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hnRNP D0 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401911-ACT | 20 µg | $397.00 |
HNRNPDはhnRNP D0(AUF1)をコードする。hnRNP D0はRNA結合タンパク質で、3′ UTRに存在するAUリッチエレメントを認識し、mRNAの分解(ターンオーバー)や翻訳を調節する。炎症、ストレス応答、細胞周期の進行、アポトーシスに関わる転写産物の安定性を制御することで、hnRNP D0は転写後の遺伝子制御ネットワークおよびプロテオスタシスの形成に寄与する。また、リボヌクレオタンパク質複合体の形成に関与し、代替的なRNAプロセシングにも影響を与えることから、サイトカイン/NF-κB関連の転写出力や細胞老化などのシグナル伝達プログラムとも結び付いている。hnRNP D0の発現量やRNA結合活性の変化は、サイトカイン産生の異常やがん化に関連する表現型と関連付けられており、疾患に関係するRNA代謝を研究する上で有用なノードとなる。
hnRNP D0 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HNRNPDの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
hnRNP D0 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HNRNPD 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHNRNPD転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性hnRNP D0の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHNRNPD遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるhnRNP D0依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHNRNPD発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるhnRNP D0経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。