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hnRNP A/B CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403454-ACT | 20 µg | $397.00 |
HNRNPAB は、ヒトの heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B(hnRNP A/B)をコードしており、転写直後の新生転写産物に結合して pre-mRNA スプライシング、選択的ポリアデニル化、mRNA の安定性、核—細胞質間輸送を制御する RNA 結合タンパク質である。hnRNP A/B はリボヌクレオタンパク質複合体の組み立てに関与し、細胞周期の進行やストレス応答性の転写出力を形作る転写後遺伝子制御プログラムを協調的に調整する。HNRNPAB の発現量やスプライシングパターンの変化を含む hnRNP ファミリーの制御異常は、複数の疾患状況で見られる異常な RNA プロセシング・ネットワークと関連づけられており、特に増殖性の表現型や神経変性に関連する表現型で顕著である。そのため、HNRNPAB は RNA 代謝、ゲノム規模のスプライシング制御、トランスクリプトームの再構築を司る経路において、しばしば研究対象となっている。
hnRNP A/B CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HNRNPABの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
hnRNP A/B CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HNRNPAB 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHNRNPAB転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性hnRNP A/Bの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHNRNPAB遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるhnRNP A/B依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHNRNPAB発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるhnRNP A/B経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。