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HDGFRP3 CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-416344-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
ヒトHDGFRP3(hepatoma-derived growth factor-related protein 3)遺伝子は、DNAおよび核酸結合性パートナーとの相互作用を介して転写制御やクロマチンダイナミクスの調節に関与するとされる、核内のクロマチン関連タンパク質をコードする。HDGFRP3は細胞周期制御、増殖、分化などの過程と関連し、形質転換細胞におけるエピジェネティック制御や遺伝子発現プログラムの文脈でしばしば研究されている。HDGFRP3の発現変化は複数のがん種で報告されており、臨床的有用性を示唆するものではないものの、腫瘍学に焦点を当てた経路研究における分子リードアウトとしての利用を支持する。ヒト細胞モデルにおけるHDGFRP3の遺伝子編集により、クロマチン依存的なシグナル伝達ネットワークの機構解明、RNA-seqやChIPなどのアッセイによる下流転写標的の同定、ならびに増殖・ストレス応答・ゲノム制御を検証する機能スクリーニングが可能となる。
HDGFRP3 CRISPR活性化プラスミド(h2)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HDGFRP3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HDGFRP3 CRISPR 活性化プラスミド (h2) は、ヒト細胞株における HDGFRP3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHDGFRP3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HDGFRP3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHDGFRP3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHDGFRP3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHDGFRP3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHDGFRP3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。