FOXQ1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403650

Panoramica

FOXQ1 (forkhead box Q1) codifica un fattore di trascrizione della famiglia forkhead che regola i programmi di linea epiteliale, la differenziazione cellulare e reti trascrizionali dipendenti dal contesto coinvolte nella motilità e nel rimodellamento tissutale. L’attività di FOXQ1 è stata associata alla modulazione dell’espressione genica legata alla transizione epitelio-mesenchimale (EMT) e al cross-talk con gli output delle vie di segnalazione Wnt/β-catenina e TGF-β, influenzando l’adesione e la dinamica del citoscheletro. Un’espressione deregolata di FOXQ1 è riportata in molteplici tipi di tumore ed è spesso associata ad alterate firme trascrizionali legate all’invasione e al potenziale metastatico. In quanto regolatore trascrizionale che si lega al DNA, FOXQ1 viene anche utilizzato per studiare la logica di promotori/enhancer e il controllo, associato alla cromatina, dell’espressione genica epiteliale.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO FOXQ1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene FOXQ1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del FOXQ1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto FOXQ1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina FOXQ1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di FOXQ1 per lo studio della segnalazione di FOXQ1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni FOXQ1 critici per la funzione di FOXQ1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di FOXQ1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal FOXQ1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal FOXQ1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus FOXQ1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal FOXQ1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR FOXQ1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia FOXQ1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio FOXQ1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.