DEP-1 CRISPR Activationプラスミド (h): sc-402501-ACT
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- DEP-1 CRISPR Activationプラスミド (h)は、特異的に遺伝子の発現量を増加させるため、相乗的活性化メディエーター(SAM)転写活性化システムです。
- DEP-1 CRISPR Activationプラスミド (h)は、1:1:1の質量比で以下の3つのプラスミドがら成る：トランス活性化ドメインVP64に溶解する非活性化されたCas9 (dCas9)ヌクレアーゼ(D10A と H840A)をコード化したのプラスミド（ブラストサイジン耐性遺伝子を含めて）、MS2-p65-HSF1融合蛋白質をコード化したのプラスミド（ハイグロマイシン耐性遺伝子を含めて）、2つのMS2 RNAアプタマーに溶解する目標特異的な20ntガイドRNAをコード化したのプラスミド（ピューロマイシン耐性遺伝子を含めて）。
- 得られたSAM複合体は、部位特異的な約200-250nt転写開始点の上流の領域に結合し、転写因子の強いリクルートメントを提供し、遺伝子の高い活性化効果が得られます。
- DEP-1 CRISPR活性化プラスミド（h）およびDEP-1 CRISPR活性化プラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、PTPRJ転写開始点の上流にある異なる調節領域を標的としています。いずれか一方、または両方のデザインが利用可能である可能性があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: DEP-1 抗体 (F-12): sc-376794
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
DEP-1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402501-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
DEP-1 CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-402501-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
PTPRJは、受容体型プロテインチロシンホスファターゼであるDEP-1をコードしており、DEP-1は細胞膜に多く局在して受容体型チロシンキナーゼ（RTK）シグナル伝達に拮抗します。DEP-1はEGFR/ERKやPI3K/AKTなどの経路に関与する基質を脱リン酸化することで、細胞増殖、接着、遊走、ならびに細胞接触依存的な増殖制御を調節します。DEP-1の活性は細胞骨格や細胞間接着（ジャンクション）に関わるプログラムとも交差し、血管内皮および上皮バリアの生物学や、免疫細胞のシグナル伝達閾値にも影響を与えます。PTPRJの発現や機能の変化は、複数のがんの文脈や炎症性表現型で見られるシグナル伝達ネットワークの破綻と関連しており、リン酸化チロシン恒常性の機構解析における有用な結節点（ノード）となります。
DEP-1 CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性PTPRJの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
DEP-1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における PTPRJ 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はPTPRJ転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性DEP-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のPTPRJ遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるDEP-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびPTPRJ発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるDEP-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。