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CLN1 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-404018-ACT | 20 µg | $397.00 |
PPT1 codifica la palmitoil‑proteina tioesterasi 1 (CLN1), un enzima lisosomiale depalmitoilante che rimuove gruppi acilici di acidi grassi legati tramite tioestere da proteine S‑acilate, favorendone il turnover e il traffico intracellulare. Regolando la proteostasi lisosomiale e la degradazione delle proteine modificate da lipidi, CLN1 influenza la dinamica endolisosomiale, la funzione del sistema autofagia‑lisosoma e l’omeostasi neuronale. La perdita dell’attività di PPT1 è associata alla ceroidolipofuscinosi neuronale (malattia CLN1), caratterizzata dall’accumulo di materiale di deposito autofluorescente e da neurodegenerazione progressiva. PPT1/CLN1 è quindi ampiamente studiata nella biologia dei lisosomi, nel controllo di qualità proteico e nei meccanismi dei disordini neurodegenerativi da accumulo.
CLN1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di PPT1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
CLN1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus PPT1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione PPT1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di CLN1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus PPT1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da CLN1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via CLN1 nelle cellule tumorali con espressione di PPT1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.