Arnt 2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403101

概要

ARNT2（aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2）は、bHLH-PAS型の転写因子をコードしており、HIFファミリーなどのパートナーとヘテロ二量体を形成して、刺激応答性の遺伝子発現プログラムを制御します。Arnt 2は、低酸素応答エレメントへのDNA結合を支え、標的座位のクロマチン依存的な制御を協調させることで、酸素感知および発生に関わる転写ネットワークに寄与します。ARNT2依存的な転写は、生存や系譜特異的な遺伝子シグネチャーに影響し得るため、神経分化や代謝的・環境的ストレスへの細胞適応に関する研究において特に重要です。ARNT2関連経路の制御異常は、低酸素シグナル伝達の出力変化や神経発生の表現型と関連づけられており、PASドメイン転写回路の機構解明に向けた有用な解析ノードとなります。

Arnt 2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるARNT2遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、ARNT2内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、ARNT2のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Arnt 2タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Arnt 2シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、ARNT2欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Arnt 2の機能に不可欠なARNT2エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ARNT2ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Arnt 2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびArnt 2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、ARNT2遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Arnt 2 HDRプラスミド（h）および Arnt 2 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはARNT2ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のARNT2標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。