ABCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-405684

概要

ABCF1（ATP-binding cassette sub-family F member 1）は、膜貫通ドメインを欠く必須の細胞質ABCタンパク質で、主に翻訳開始およびリボソーム関連プロセスに機能します。eIF2/eIF2B軸の構成要素や他の開始因子と相互作用し、ATP依存的な制御を、細胞ストレスや自然免疫シグナル伝達下におけるタンパク質合成制御へと結び付けます。さらにABCF1は、NF-κB関連の炎症経路や核酸によって誘導される応答にも関与するとされ、翻訳制御を抗ウイルスおよびサイトカインプログラムと連動させます。ABCF1の発現や活性の破綻は、がんや炎症性疾患モデルにおける増殖や免疫表現型の変化と関連しており、ストレス適応や宿主防御の機序研究において有用な対象であることが示唆されています。

ABCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるABCF1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、ABCF1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、ABCF1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、ABCF1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、ABCF1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、ABCF1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• ABCF1の機能に不可欠なABCF1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ABCF1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• ABCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびABCF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、ABCF1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  ABCF1 HDRプラスミド（h）および ABCF1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはABCF1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のABCF1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。