SMCHD1의 억제제는 후성유전학적 조절인자와 염색질 리모델링 과정을 표적으로 삼아 그 기능에 간접적으로 영향을 미치는 다양한 화합물을 포함합니다. SMCHD1은 염색체 응축과 유전자 침묵, 특히 X-염색체 비활성화 및 게놈 각인에 관여합니다. SMCHD1 활성의 조절은 일반적으로 DNA 메틸화 및 히스톤 변형을 포함한 후성유전학적 환경에 영향을 미치는 것을 포함합니다. 트리코스타틴 A, 채토신, 시르티놀, 스크립타이드와 같은 화합물은 히스톤 탈아세틸화 효소 및 메틸전달효소의 억제제입니다. 이러한 약물은 염색질 구조를 변경하여 단백질이 염색질에 결합하고 수정하는 능력에 영향을 미침으로써 SMCHD1에 간접적으로 영향을 줄 수 있습니다. 예를 들어, 트리코스타틴 A는 히스톤 아세틸화 수준을 변화시켜 SMCHD1에 의해 조절되는 유전자 발현 패턴에 영향을 줄 수 있습니다.
5-아자시티딘, 데시타빈, RG108과 같은 DNA 메틸전달효소 억제제는 DNA 메틸화 패턴을 변경합니다. 이 단백질은 종종 DNA 메틸화에 의해 지배되는 유전자 침묵 메커니즘에 관여하는 것으로 알려져 있기 때문에 이러한 변화는 SMCHD1의 기능을 조절할 수 있습니다. DNA 결합 단백질 억제제인 미트라마이신 A는 전사 환경을 변경하여 SMCHD1의 활성에 간접적으로 영향을 미칠 수 있습니다. 알데히드 탈수소효소를 억제하는 역할을 하는 것으로 알려진 디설피람은 산화 스트레스와 세포 대사에 미치는 영향을 통해 SMCHD1과 같은 염색질 변형 단백질에도 영향을 미칠 수 있습니다. MG132와 같은 프로테아좀 억제제는 염색질 리모델링 및 유전자 조절에 관여하는 단백질을 안정화하여 SMCHD1에 간접적으로 영향을 미칠 수 있습니다. 광범위한 생물학적 활성을 가진 천연 화합물인 커큐민은 DNA 메틸화 및 히스톤 변형과 관련된 경로를 조절하여 SMCHD1 기능에 영향을 미칠 수 있습니다.
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