HDA2를 억제하도록 설계된 화학 물질은 주로 탈아세틸화 효소 활성을 담당하는 촉매 도메인을 방해하는 방식으로 작용합니다. 예를 들어, 트리코스타틴 A와 보리노스타트는 모두 클래스 I 및 II HDAC에 작용하여 히스톤 및 비히스톤 단백질에서 아세틸기를 제거하는 HDA2의 능력을 효과적으로 차단하는 HDAC 억제제입니다. 이러한 장애는 아세틸화된 히스톤의 증가로 이어져 HDA2가 유전자 발현에서 수행하는 조절 역할에 영향을 미칩니다. 단쇄 지방산인 부티레이트 나트륨도 HDA2를 포함한 클래스 I 및 II HDAC의 탈아세틸화 활성을 차단하여 이 단백질에 의해 매개되는 유전자 침묵을 감소시킵니다. 마찬가지로, 모세티노스타트와 아피시딘은 각각 동형 선택적 및 클래스 I HDAC 억제제로서 HDA2의 효소 도메인을 방해하여 후성 유전적 조절을 변화시킵니다.
반면에 파노비노스타트와 벨리노스타트는 HDA2를 포함한 여러 HDAC의 효소 활동을 광범위하게 방해하는 범 HDAC 억제제입니다. 이러한 억제제는 히스톤의 아세틸화를 증가시켜 유전자 발현 프로필을 변화시킵니다. 엔티노스타트와 로마뎁신은 1등급 HDAC에 대한 특이성이 특징이며, 이 두 약물은 HDA2의 탈아세틸화 기능에 직접적인 영향을 미쳐 아세틸화를 증가시키고 결과적으로 유전자 조절에 혼란을 일으킵니다. JNJ-26481585 와 같은 2세대 HDAC 억제제는 더 높은 효능을 유지하면서 여러 HDAC를 표적으로 삼도록 설계되었습니다. HDA2의 경우, 이는 일반적으로 이 단백질에 의해 매개되는 유전자 억제를 변화시킵니다. 투바스타틴 A는 HDA2에 대한 효능은 낮지만 교차 반응을 통해 영향을 미쳐 아세틸화 수준을 높여 유전자 조절에서의 역할을 방해할 수 있습니다.
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