강력한 키나아제 억제제인 스타우로스포린은 이러한 효소의 방대한 배열에 결합하여 효과를 발휘하므로 수많은 단백질 기능에 중요한 인산화 과정을 방해합니다. 또 다른 화합물인 LY294002는 PI3K에 집중하여 세포 생존과 신진대사에 중요한 역할을 하는 단백질 키나아제 B(Akt)를 활성화하는 캐스케이드를 중단시킵니다. 이러한 봉쇄는 신호 네트워크를 통해 반향을 일으켜 PI3K/Akt에 의해 조절되는 단백질에 영향을 미칠 수 있습니다. 세포의 수렁에 더 깊이 들어가면 PD173074는 섬유아세포 성장인자 수용체를 방해하여 세포 성장과 증식을 지시하는 경로를 억제합니다. 이와 함께 SB431542는 TGF-베타 수용체에 대항하여 신호 전달을 무효화하고 TGF-베타에 의해 조절되는 단백질에 영향을 미칩니다. 이러한 개입은 세포 환경을 크게 변화시킬 수 있습니다. 이러한 영향은 단백질 합성 기계의 하향 조절을 조율하여 단백질 수준과 기능에 영향을 미치는 mTOR 억제제인 라파마이신과 함께 확장됩니다.
세포 항상성 유지에 중요한 단백질의 안정성과 회전율은 프로테아좀 억제제인 보르테조밉의 영향을 받습니다. 보르테조밉은 단백질 분해를 방지함으로써 잠재적으로 C16orf82를 포함한 단백질의 축적을 유도하여 기능적 역학을 변화시킬 수 있습니다. 한편, ZM-447439는 유사 분열의 주요 조절자인 오로라 키나아제를 표적으로 하며, PD98059는 U0126과 함께 MAPK/ERK 경로 내의 MEK 효소를 특이적으로 억제하여 이 경로에 의존하는 단백질의 활성화에 영향을 미칩니다. 스트레스 자극에 반응하는 JNK 경로는 SP600125에 의해 해결되어 스트레스 활성화 경로에 의해 조절되는 단백질의 운명을 바꿉니다. 마찬가지로 Y-27632는 Rho/ROCK 신호를 방해하여 세포 골격 구조와 이와 관련된 단백질에 영향을 미칩니다. 티로신 키나제 억제제인 이매티닙은 BCR-ABL과 c-Kit에 영향을 미침으로써 다양한 신호 경로를 변경하여 관련 단백질의 활성을 조절할 수 있는 잠재력을 보여줍니다.
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