β-1,4-갈락토실 트랜스퍼라제 4(β-1,4-Gal-T4)의 화학적 억제제는 다양한 생화학적 메커니즘을 통해 효소의 기능을 방해할 수 있습니다. UDP는 경쟁 억제제 역할을 하여 β-1,4-Gal-T4의 활성 부위에 결합하고 천연 기질과 결합하지 못하게 합니다. 이는 일반적인 촉매 과정을 차단하여 효소의 글리코실 트랜스퍼라제 활성을 효과적으로 감소시킵니다. 마찬가지로 2-데옥시-D-포도당은 기질 유사체로 작용하여 일반 당 대신 당단백질에 통합됩니다. 이러한 통합은 효소가 의도한 기질을 올바르게 인식하고 처리하는 능력을 방해합니다. 또 다른 측면에서 PD98059는 β-1,4-Gal-T4에 대한 조절 효과가 있는 MAPK/ERK 신호 전달 경로를 표적으로 하여 효소의 활동을 간접적으로 감소시킵니다. 프로테아좀 억제제인 MG132는 잘못 접힌 당단백질의 축적을 유발하여 세포의 단백질 접힘 메커니즘을 포화시키고 β-1,4-Gal-T4 기능에 필요한 올바르게 접힌 기질의 가용성을 감소시킬 수 있습니다.
또한, 카스타노스페르민과 스와인소닌과 같은 억제제는 각각 당단백질의 적절한 접힘과 트림에 필요한 효소인 글루코시다아제와 만노시다아제 II를 억제하여 당단백질 처리를 방해하고, β-1,4-Gal-T4는 이를 수정합니다. 이러한 억제는 제대로 처리된 기질의 부족으로 인해 효소의 활성을 감소시킵니다. 노지리마이신과 그 유도체인 데옥시노지리마이신은 각각 헥소사미니다아제와 글루코시다아제를 표적으로 하여 효소의 주의를 끌기 위해 올바른 기질과 경쟁하는 부적절하게 처리된 당단백질의 과잉을 초래합니다. 키푸넨신이 만노시다제 I을 억제하면 β-1,4-Gal-T4의 작용에 적합하지 않은 당단백질도 잘못 처리됩니다. 브레펠딘 A는 β-1,4-Gal-T4가 국소화되어 작동하는 골지체의 구조와 기능을 방해하여 당단백질을 수정하는 효소의 능력을 심각하게 손상시킵니다. 마지막으로 투니카마이신과 1-데옥시만노지리마이신은 각각 N-연결 당화 형성을 방지하고 만노시다아제 I을 억제합니다. 이를 통해 β-1,4-Gal-T4의 기질 역할을 하는 당단백질이 올바른 형태로 생성되지 않거나 제대로 처리되지 않도록 하여 효소의 전반적인 기능을 억제합니다.
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