YY1ゲルシフトオリゴヌクレオチドは、タンパク質-DNA相互作用を精査するために用いられる分子生物学の基礎技術であるゲルシフトアッセイで使用するために細心の注意を払って作られたDNAの短い配列である。Yin Yang 1(YY1)転写因子にちなんで命名されたこのオリゴヌクレオチドは、遺伝子制御、細胞増殖、分化、アポトーシスにおいて多様な役割を持つ多機能転写因子であるYY1が認識するコンセンサス結合配列に由来する。YY1は、標的遺伝子のプロモーターやエンハンサー内のYY1モチーフと呼ばれる特定のDNA配列に結合することにより、その転写活性を調節する。ゲルシフトアッセイでYY1ゲルシフトオリゴヌクレオチドを利用することにより、研究者は様々な実験条件下で、YY1モチーフに対するYY1の結合速度、特異性、親和性を調べることができる。この手法により、YY1が介在する遺伝子制御の根底にある分子メカニズムの解明が容易になり、発生、分化、発がんなどの細胞プロセスを支配する複雑なシグナル伝達ネットワークに対する洞察が得られる。
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