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TRIM29 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402144-ACT | 20 µg | $397.00 |
TRIM29(tripartite motif containing 29)はRBCC/TRIMファミリーに属するタンパク質で、DNA損傷応答の制御、上皮分化、ならびに細胞ストレスシグナル伝達に関与するとされています。TRIM29はクロマチン関連プロセスを調節し、p53関連ネットワークとの相互作用や修復因子のリクルートを含む、ゲノム安定性に結び付いた経路に影響を及ぼすことが報告されています。TRIM29の発現は複数の腫瘍タイプでしばしば破綻しており、増殖や浸潤、遺伝毒性ストレスへの応答の変化と関連づけられています。これらの特性により、TRIM29は転写制御、DNA修復経路間のクロストーク、そして文脈依存的な発がん性または腫瘍抑制性の表現型を研究するうえで有用なノードとなります。
TRIM29 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性TRIM29の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TRIM29 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における TRIM29 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はTRIM29転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TRIM29の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のTRIM29遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTRIM29依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびTRIM29発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTRIM29経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。