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RPRD1B CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-412911-ACT | 20 µg | $397.00 |
RPRD1B は、RNA ポリメラーゼ II と会合し、転写伸長および共転写的 RNA プロセシングの協調に寄与する CTD 結合タンパク質をコードします。POLR2A のリン酸化 C 末端ドメイン(CTD)に結合することで、RPRD1B は転写のタイミング、プロモーター近傍でのポーズ(停止)、ならびに細胞周期制御やストレス応答性遺伝子発現に影響する mRNA 成熟プログラムの調節を助けます。RPRD1B のような転写調節因子の発現変化や制御破綻は、全体的な転写バランスやゲノム維持経路が乱れる疾患生物学、とりわけがんに伴う転写リプログラミングを含む状況において重要です。そのため本遺伝子は、Pol II の CTD シグナル伝達と下流のトランスクリプトーム変化を結び付ける機序研究に有用です。
RPRD1B CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性RPRD1Bの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
RPRD1B CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における RPRD1B 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はRPRD1B転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性RPRD1Bの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のRPRD1B遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるRPRD1B依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびRPRD1B発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるRPRD1B経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。