Oct-1 Gel Shift Oligonucleotides: sc-2506
- consensus binding site for Oct family homeodomain transcription factors; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2506
- also available as mutant oligonucleotide with an "AT"→"GC" substitution in Oct DNA binding motif; sc-2515
- 5′-TGT CGA ATG CAA ATC ACT AGA A-3′
Oct-1 ゲルシフトオリゴヌクレオチドは、タンパク質-DNA相互作用の研究に用いられる分子生物学の基本技術であるゲルシフトアッセイ用にデザインされた短いDNA配列である。これらのオリゴヌクレオチドは、転写因子のPOU（Pit-Oct-Unc）ドメインファミリーに属するOct-1転写因子のコンセンサス結合配列に由来する。Oct-1は、標的遺伝子のプロモーター内にあるオクタマー・モチーフとして知られる特定のDNA配列に結合することにより、遺伝子発現の制御において重要な役割を果たしている。標的部位に結合すると、Oct-1は、その状況や他の制御タンパク質との相互作用に応じて、遺伝子の転写を活性化したり抑制したりする。ゲルシフトアッセイでOct-1ゲルシフトオリゴヌクレオチドを利用することにより、研究者は様々な実験条件下で、Oct-1の8量体モチーフへの結合速度、特異性、親和性を調べることができる。この技術により、Oct-1が介在する遺伝子制御の根底にある分子メカニズムが解明され、発生、分化、増殖などの細胞プロセスを支配する複雑なシグナル伝達ネットワークについての洞察が得られる。
参考文献:
- オクタマー転写因子-1は, 肝核因子-1αを介したヒトUDPグルクロン酸転移酵素2B7プロモーターの活性化を促進する。 | Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
- 腫瘍壊死因子α遺伝子（TNFA）プロモーターの機能的一塩基多型（SNP）部位へのユビキタス転写因子OCT-1のアレル特異的結合。 | Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
- 初代T細胞およびT細胞株におけるマウスIL-5 CLE0への8量体因子の結合。 | Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
- 3-ヒドロキシ-3-メチルグルタリル補酵素A還元酵素阻害剤は, 単核細胞におけるOct-1の結合活性と核内レベルを増加させる。 | Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
- マウス乳腺におけるβ-カゼイン遺伝子発現の転写制御におけるOct-1の関与。 | Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
- TALEホメオドメインタンパク質は, ゴナドトロピン放出ホルモン遺伝子の発現を, 独立して, あるいはOct-1との相互作用を介して制御している。 | Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
- Oct-1と核内因子YはSURG-1エレメントに結合し, 基礎およびゴナドトロピン放出ホルモン（GnRH）刺激によるマウスGnRH受容体遺伝子の転写を指令する。 | Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
- 漢方薬Tripterygium wilfordii Hook Fの有効成分であるトリプトライドは, 誘導性一酸化窒素合成酵素遺伝子の転写を減少させることにより, 一酸化窒素の産生を阻害する。 | Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
- c-Junと8量体結合タンパク質-1によるラットCYP4A2遺伝子プロモーターの制御。 | Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
- 血清インターロイキン-6濃度と機能的IL6 -6331T>C多型との関連。 | Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
- ラミンB1はOct-1を介して酸化ストレス応答を制御する。 | Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
- ヒト誘導性一酸化窒素合成酵素遺伝子のサイトカイン誘導性転写は, Oct-1モチーフによって制御されている。 | Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
- ヒトパピローマウイルス31b型エンハンサーの転写活性は, AP1と2つの新規細胞因子の相乗的相互作用によって制御されている。 | Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
- Oct-1はGnRH遺伝子の転写に必要なプロモーターエレメントと結合する。 | Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
Oct-1 consensus oligonucleotide | sc-2506 | 500 ng/25 µl | $49.00 | |||
Oct-1 mutant oligonucleotide | sc-2515 | 500 ng/25 µl | $49.00 |