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OC-2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404081-ACT | 20 µg | $397.00 |
ONECUT2(OC-2)は、系譜指定および分化プログラムを制御するホメオボックス型転写因子をコードしており、特に内胚葉系および上皮性の文脈で重要な役割を担います。DNA結合性の制御因子として、OC-2は細胞の同一性、増殖、発生パターニングを司る転写ネットワークを統合的に調整し、より広範なクロマチン/転写機構とも相互作用します。ONECUT2の発現異常は、増殖制御、浸潤関連プログラム、細胞可塑性の変化を含む腫瘍性表現型に関連した遺伝子発現状態の変容と結び付けられています。これらの特性により、ONECUT2はヒト細胞モデルにおける転写回路、エピジェネティック制御、疾患に関連する状態遷移を研究するうえで有用な標的となります。
OC-2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ONECUT2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
OC-2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ONECUT2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はONECUT2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性OC-2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のONECUT2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるOC-2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびONECUT2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるOC-2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。