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NUDT21 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402082-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトNUDT21は、pre-mRNA上のUGUA配列を認識し、3′末端プロセシングおよびpoly(A)付加部位の選択を促進するcleavage factor Im(CFIm)複合体の中核構成因子をコードする。選択的ポリアデニル化を制御することにより、NUDT21は3′UTR長、転写産物の安定性、局在、翻訳制御を規定し、結果として全体的な遺伝子発現プログラムに影響を与える。このRNAプロセシングにおける役割を通じて、NUDT21はmRNAアイソフォーム利用の協調的な調節により、細胞周期制御、分化、ストレス応答を司る経路と結び付いている。NUDT21が関与するCFIm活性の破綻や選択的ポリアデニル化パターンの変化は、がんにおける疾患関連の転写制御再編や神経発達表現型と関連づけられており、転写後制御の機構研究に有用なノードとなっている。
NUDT21 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NUDT21の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
NUDT21 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NUDT21 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNUDT21転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性NUDT21の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNUDT21遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるNUDT21依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNUDT21発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるNUDT21経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。