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NELF-B CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-405667-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトNELFBは、Negative Elongation Factor(NELF)複合体の中核サブユニットであるNELF-Bをコードしており、DSIFと協調してRNAポリメラーゼIIのプロモーター近傍でのポーズ(停止)を強制し、転写伸長の初期過程を形成します。ポーズ解除や転写キネティクスを制御することで、NELF-Bは刺激応答性の遺伝子プログラム、エンハンサー—プロモーター間コミュニケーション、さらにはクロマチンに連動した広範な遺伝子発現制御に影響を与えます。NELF依存的なポーズは、細胞周期進行、分化、ストレス応答を司る経路と密接に結びついており、NELFBの機能は転写制御異常の機構解明研究において重要です。伸長制御の調節異常は多様な疾患状況で関与が示唆されていることから、NELFBの撹乱は、ポーズ動態が下流の表現型に与える影響をモデル化するために有用です。
NELF-B CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NELFBの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
NELF-B CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NELFB 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNELFB転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性NELF-Bの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNELFB遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるNELF-B依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNELFB発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるNELF-B経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。