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KCTD13 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404120-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトKCTD13は、BTB/POZドメインを含むアダプタータンパク質をコードしており、CUL3依存性のE3ユビキチンリガーゼ複合体を組み立てることで、基質のユビキチン化とプロテオスタシスを制御します。タンパク質分解・代謝回転の調節を介して、KCTD13は細胞周期の進行、細胞骨格ダイナミクス、ならびに神経発達やシナプス機能を形作るシグナル伝達経路の制御に関与することが示されています。16p11.2領域におけるKCTD13の遺伝子量(コピー数)の変動は神経発達表現型の変化と関連しており、遺伝子量効果や経路感受性を研究するうえで有用なノードとなります。さらに、KCTDファミリーのメンバーが関与するユビキチン介在性制御の破綻は、モデル系における細胞恒常性やストレス応答のより広範な機構とも関連します。
KCTD13 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性KCTD13の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
KCTD13 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における KCTD13 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はKCTD13転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性KCTD13の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のKCTD13遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるKCTD13依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびKCTD13発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるKCTD13経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。