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IGF2BP3 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-431213-ACT | 20 µg | $397.00 |
Igf2bp3 は、m6A 修飾された転写産物を認識し、mRNA の安定性・局在・翻訳を調節する腫瘍胎児性(oncofetal)の RNA 結合タンパク質 IGF2BP3 をコードする。IGF2BP3 は、増殖・生存・遊走を支える転写後の遺伝子制御プログラムに影響を及ぼし、増殖因子シグナル伝達や細胞周期制御経路とも交差する。マウス系では、Igf2bp3 の活性は発生過程の文脈や、胎児期の RNA 制御ネットワークの再活性化がみられる異常増殖モデルで一般的に研究されている。IGF2BP3 に関連する RNA レギュロンの破綻は、複数の疾患関連研究の場面で、細胞状態遷移の変化や浸潤性表現型と結び付けられてきた。
IGF2BP3 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Igf2bp3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
IGF2BP3 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Igf2bp3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はIgf2bp3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性IGF2BP3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のIgf2bp3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるIGF2BP3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびIgf2bp3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるIGF2BP3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。