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HoxB2CRISPR激活质粒(h) | sc-404533-ACT | 20 µg | $397.00 |
HOXB2 编码同源盒转录因子 HoxB2。HoxB2 是一种 DNA 结合型调控蛋白,在胚胎发育过程中帮助建立前后轴模式与体节身份,尤其在后脑以及来源于神经嵴的细胞谱系中尤为重要。HoxB2 通过 HOX 转录网络并与 PBX、MEIS 等辅因子相互作用,调控决定细胞命运指定、分化以及对形态发生信号响应的基因表达程序。HOXB2 表达失调与发育信号改变及异常转录状态相关,并在包括癌症在内的人类疾病情境中被观察到;在这些情况下,HOX 基因程序可影响细胞增殖、迁移与谱系可塑性。作为转录调控因子,HoxB2 是在模型系统中研究基因调控回路与发育通路再激活的一个易于操控的关键节点。
HoxB2 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性HOXB2的表达。
HoxB2 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的HOXB2基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于HOXB2转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性HoxB2表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的HOXB2位点,并能够研究内源性位点上依赖于HoxB2的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在HOXB2表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟HoxB2通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。