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hnRNP ICRISPR激活质粒(h) | sc-401435-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
hnRNP ICRISPR激活质粒(h2) | sc-401435-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
PTBP1 编码人类 RNA 结合蛋白 hnRNP I。该蛋白是转录后基因表达的多功能调控因子,能够结合富含多聚嘧啶的序列基序,从而控制可变剪接、mRNA 稳定性以及翻译过程。hnRNP I 与剪接体核心组分协同,协调剪接位点的选择,并调节塑造细胞状态转换的 RNA 加工程序,包括神经元分化和应激反应相关基因表达。通过影响外显子包含、与无义介导的 mRNA 降解(NMD)的耦联,以及依赖内部核糖体进入位点(IRES)的翻译,PTBP1 进而影响代谢、细胞周期调控和 RNA 监视等通路。PTBP1 活性失调及剪接程序重塑与肿瘤生物学以及神经发育或神经退行性变相关的转录组变化有关,因此它是开展 RNA 加工机制研究的一个重要节点。
hnRNP I CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性PTBP1的表达。
hnRNP I CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的PTBP1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于PTBP1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性hnRNP I表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的PTBP1位点,并能够研究内源性位点上依赖于hnRNP I的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在PTBP1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟hnRNP I通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。