HNF-3γ CRISPR Activationプラスミド (h): sc-401720-ACT
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- HNF-3γ CRISPR Activationプラスミド (h)は、特異的に遺伝子の発現量を増加させるため、相乗的活性化メディエーター(SAM)転写活性化システムです。
- HNF-3γ CRISPR Activationプラスミド (h)は、1:1:1の質量比で以下の3つのプラスミドがら成る：トランス活性化ドメインVP64に溶解する非活性化されたCas9 (dCas9)ヌクレアーゼ(D10A と H840A)をコード化したのプラスミド（ブラストサイジン耐性遺伝子を含めて）、MS2-p65-HSF1融合蛋白質をコード化したのプラスミド（ハイグロマイシン耐性遺伝子を含めて）、2つのMS2 RNAアプタマーに溶解する目標特異的な20ntガイドRNAをコード化したのプラスミド（ピューロマイシン耐性遺伝子を含めて）。
- 得られたSAM複合体は、部位特異的な約200-250nt転写開始点の上流の領域に結合し、転写因子の強いリクルートメントを提供し、遺伝子の高い活性化効果が得られます。
- HNF-3γ CRISPR活性化プラスミド（h）およびHNF-3γ CRISPR活性化プラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、FOXA3転写開始点の上流にある異なる調節領域を標的としています。いずれか一方、または両方のデザインが利用可能である可能性があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: HNF-3γ 抗体 (A-2): sc-74424
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
HNF-3γ CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401720-ACT | 20 µg | $397.00 | |||
HNF-3γ CRISPR Activationプラスミド (h2) | sc-401720-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
FOXA3は、肝細胞核因子3ガンマ（HNF-3γ）をコードしており、内胚葉系譜のプログラムの確立と維持を助け、上皮分化および代謝恒常性に関与する遺伝子を制御するフォークヘッドボックス型の転写因子です。HNF-3γは、クロマチンのアクセシビリティやプロモーター／エンハンサー活性を協調させる転写ネットワークに関与し、糖・脂質代謝、肝機能、消化管発生を制御する経路と交差します。ヒト細胞では、FOXA3の活性が細胞アイデンティティの決定や、状況依存的な遺伝子制御回路のリモデリングに寄与します。FOXA3／HNF-3γの発現異常、あるいは下流の転写プログラムの破綻は、肝臓および消化管の生物学における分化状態の変化や疾患関連表現型と関連づけられており、機序解明研究に有用な結節点となります。
HNF-3γ CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性FOXA3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HNF-3γ CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における FOXA3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はFOXA3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HNF-3γの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のFOXA3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHNF-3γ依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびFOXA3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHNF-3γ経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。