HIF-1αゲルシフトオリゴヌクレオチドは、タンパク質-DNA相互作用の解明を目的とした分子生物学研究において重要な手法であるゲルシフトアッセイで使用するために、綿密に合成された短いDNA配列である。HIF-1α」とは、低酸素誘導因子1αのことで、低酸素または低酸素レベルに対する細胞応答に関与する重要な転写因子である。HIF-1αはHIF-1ヘテロ二量体転写因子複合体のサブユニットであり、血管新生、赤血球造血、グルコース代謝、細胞生存など、低酸素条件への適応に関与する遺伝子の発現を制御する。正常酸素条件下では、HIF-1αはプロリルヒドロキシラーゼ酵素によって水酸化され、ユビキチン-プロテアソーム経路を介して分解される。しかし、低酸素条件下では、HIF-1αは安定化され、核に移動し、そこでHIF-1βおよび他のコアクチベーターと複合体を形成し、標的遺伝子のプロモーター内の低酸素応答エレメント(HRE)として知られる特定のDNA配列に結合し、それによって転写活性を調節する。ゲルシフトアッセイでHIF-1αゲルシフトオリゴヌクレオチドを利用することにより、研究者は様々な実験条件下でHIF-1αの標的DNA配列への結合速度、特異性、親和性を調べることができる。この技術は、HIF-1αが介在する遺伝子制御の根底にある分子メカニズムの解明を容易にし、低酸素に対する細胞応答を支配する複雑なシグナル伝達ネットワークについての洞察を提供する。
参考文献:
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