Date published: 2025-9-7

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HIF-1α Gel Shift Oligonucleotides: sc-2625

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  • consensus binding site for HIF-1α; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2625
  • also available as mutant oligonucleotide with "CGT"→"AAA" substitution in the HIF-1α binding motif; sc-2626
  • 5'-TCT GTA CGT GAC CAC ACT CAC CTC-3'

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関連項目

HIF-1αゲルシフトオリゴヌクレオチドは、タンパク質-DNA相互作用の解明を目的とした分子生物学研究において重要な手法であるゲルシフトアッセイで使用するために、綿密に合成された短いDNA配列である。HIF-1α」とは、低酸素誘導因子1αのことで、低酸素または低酸素レベルに対する細胞応答に関与する重要な転写因子である。HIF-1αはHIF-1ヘテロ二量体転写因子複合体のサブユニットであり、血管新生、赤血球造血、グルコース代謝、細胞生存など、低酸素条件への適応に関与する遺伝子の発現を制御する。正常酸素条件下では、HIF-1αはプロリルヒドロキシラーゼ酵素によって水酸化され、ユビキチン-プロテアソーム経路を介して分解される。しかし、低酸素条件下では、HIF-1αは安定化され、核に移動し、そこでHIF-1βおよび他のコアクチベーターと複合体を形成し、標的遺伝子のプロモーター内の低酸素応答エレメント(HRE)として知られる特定のDNA配列に結合し、それによって転写活性を調節する。ゲルシフトアッセイでHIF-1αゲルシフトオリゴヌクレオチドを利用することにより、研究者は様々な実験条件下でHIF-1αの標的DNA配列への結合速度、特異性、親和性を調べることができる。この技術は、HIF-1αが介在する遺伝子制御の根底にある分子メカニズムの解明を容易にし、低酸素に対する細胞応答を支配する複雑なシグナル伝達ネットワークについての洞察を提供する。

参考文献:

  1. 低酸素は, RN46A神経細胞において, 血小板由来成長因子(PDGF)-B/PDGF-β受容体/ホスファチジルイノシトール3-キナーゼ/Aktシグナルを介して, オートクリン-パラクリン生存経路を誘導する。  |  Zhang, SX., et al. 2003. FASEB J. 17: 1709-11. PMID: 12958184
  2. 糖尿病マウスの皮膚修復過程における低酸素誘導性因子1α蛋白合成および機能に対するインスリン様成長因子1刺激の減少の影響。  |  Yu, DH., et al. 2007. Wound Repair Regen. 15: 628-35. PMID: 17971008
  3. 糖尿病性腎症における色素上皮由来因子の抗炎症作用。  |  Wang, JJ., et al. 2008. Am J Physiol Renal Physiol. 294: F1166-73. PMID: 18322021
  4. プラセンタ成長因子は低酸素誘導因子-1αを介してエンドセリン-1およびエンドセリン-B受容体の発現を増強する。  |  Patel, N., et al. 2008. Blood. 112: 856-65. PMID: 18411415
  5. フェルラ酸はVEGF, PDGF, HIF-1αを介して血管新生を増強する。  |  Lin, CM., et al. 2010. J Nutr Biochem. 21: 627-33. PMID: 19443196
  6. 骨髄性細胞白血病-1(Mc1-1)は, 精巣における低酸素誘導因子-1(HIF-1)の標的遺伝子候補である。  |  Palladino, MA., et al. 2012. Reprod Biol Endocrinol. 10: 104. PMID: 23216940
  7. 先進糖化最終産物は腎細胞のHIF転写活性に影響を及ぼす。  |  Bondeva, T., et al. 2013. Mol Endocrinol. 27: 1918-33. PMID: 24030251
  8. シンバスタチンとその下流の阻害剤は, IGHV変異のないCLL細胞において, ドキソルビシンに対する構成的および間質細胞誘導性の耐性を回避する。  |  Rigoni, M., et al. 2015. Oncotarget. 6: 29833-46. PMID: 26284584
  9. アルコール性肝炎は, 幹細胞の増加とmiR-122を介したHIF-1αの活性化により, 初期の肝胆道癌を加速する。  |  Ambade, A., et al. 2016. Sci Rep. 6: 21340. PMID: 26888602
  10. 肝細胞癌は, hif-1α誘導性IL-10を介したM2マクロファージ極性化が関与するNASHによって加速される。  |  Ambade, A., et al. 2016. Oncoimmunology. 5: e1221557. PMID: 27853646
  11. GRLH2によって制御されるマイクロRNA 122は, マウスおよび患者の肝臓をエタノール誘発性肝疾患から保護する。  |  Satishchandran, A., et al. 2018. Gastroenterology. 154: 238-252.e7. PMID: 28987423
  12. マクロファージ特異的低酸素誘導因子-1αは非アルコール性脂肪性肝炎における自己貪食フラックスの障害に寄与する。  |  Wang, X., et al. 2019. Hepatology. 69: 545-563. PMID: 30102772
  13. バイカレインは, 好気的解糖を減少させ, 低酸素誘導因子-1αの阻害を介してミトコンドリア機能障害を逆転させることにより, タモキシフェン耐性乳癌細胞を再感作する。  |  Chen, Y., et al. 2021. Clin Transl Med. 11: e577. PMID: 34841716

注文情報

製品名カタログ #単位価格数量お気に入り

HIF-1α consensus oligonucleotide

sc-2625
500 ng/25 µl
$49.00

HIF-1α mutant oligonucleotide

sc-2626
500 ng/25 µl
$49.00