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FBP2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404139-ACT | 20 µg | $397.00 |
KHSRPは、KH型スプライシング制御タンパク質(FBP2)をコードしており、前駆体mRNA(pre-mRNA)のスプライシング、mRNAの安定性、局在、翻訳を制御することで、転写後の遺伝子発現制御を統合的に担うRNA結合因子です。FBP2はAUリッチエレメントやGリッチなRNAモチーフと相互作用し、細胞分化、ストレス応答、炎症性シグナル伝達の出力を形作るRNA代謝プログラムを調節します。RNAのプロセシングおよび分解(ターンオーバー)における役割を通じて、KHSRPは増殖やアポトーシスに関連する経路にも影響を与え、KHSRP活性の変化は、がん生物学、免疫機能異常、神経疾患の文脈で観察される遺伝子発現の破綻したシグネチャーと関連づけられています。これらの性質により、KHSRPはRNA制御ネットワークと、それが細胞状態の遷移に及ぼす影響を解明するための有用な標的となります。
FBP2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性KHSRPの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
FBP2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における KHSRP 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はKHSRP転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性FBP2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のKHSRP遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるFBP2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびKHSRP発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるFBP2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。