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epiplakin 1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404271-ACT | 20 µg | $397.00 |
EPPK1はエピプラキン1(epiplakin 1)をコードしており、これはケラチン中間径フィラメントに結合して細胞骨格の構築や上皮の機械的安定性に寄与する、プラキンファミリーに属する大型の細胞骨格リンカー(サイトリンカー)タンパク質です。エピプラキンはフィラメントネットワークの足場として働くことで、細胞接着、遊走、ストレス応答といった、上皮の恒常性維持やバリア機能の健全性に不可欠なプロセスに影響を与えます。細胞骨格の連結異常や上皮構造の変化は、組織傷害やリモデリングにしばしば関与するため、EPPK1は上皮の分化状態やストレス誘導性の再編成を研究するうえで有用なマーカーとなります。そのため、上皮生物学、炎症に関連する組織損傷、腫瘍細胞の可塑性といった幅広い研究領域で、EPPK1の発現およびフィラメント結合機能が注目されています。
epiplakin 1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性EPPK1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
epiplakin 1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における EPPK1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はEPPK1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性epiplakin 1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のEPPK1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるepiplakin 1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびEPPK1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるepiplakin 1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。