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EGR1 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-420133-ACT | 20 µg | $397.00 |
Early growth response 1(Egr1)は、亜鉛フィンガー型転写因子EGR1をコードする遺伝子で、増殖因子、ストレスシグナル、神経活動によって迅速に誘導される即時早期遺伝子です。EGR1はGCリッチなプロモーター要素に結合し、クロマチンおよび転写応答を協調させることで、細胞周期進行、アポトーシス、分化、シナプス可塑性を制御するプログラムを調節します。マウスでは、EGR1はMAPK/ERKシグナル伝達の下流に位置する重要なハブであり、カルシウム依存性経路や炎症性シグナルからの入力を統合して、刺激依存的な遺伝子発現を形成します。EGR1活性の破綻は、神経適応、免疫活性化、線維化に伴うリモデリング、がん遺伝子性の転写ネットワークなどの文脈で関与が示唆されており、シグナルから転写へ至る結合(signal-to-transcription coupling)の機構研究に有用です。
EGR1 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Egr1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
EGR1 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Egr1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はEgr1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性EGR1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のEgr1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるEGR1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびEgr1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるEGR1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。