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E2F-6 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403615-ACT | 20 µg | $397.00 |
E2F6はE2F-6をコードしており、E2Fファミリーに属する非典型的な転写調節因子です。RB結合に依存せず、主として転写抑制因子として機能します。DNA複製やS期への移行に関わるE2F応答遺伝子をサイレンシングすることで、細胞周期制御と分化に寄与し、さらにポリコーム群(Polycomb group)複合体をリクルートすることにより、クロマチン関連の抑制にも関与します。これらの機構を通じて、E2F-6は発生過程や細胞状態の移行において適切な転写プログラムの維持を助けます。E2F6活性の破綻は、がん生物学における増殖制御やエピジェネティック制御の異常と関連していることが報告されており、がん遺伝子性の転写ネットワークや系譜可塑性(lineage plasticity)の研究において重要です。
E2F-6 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性E2F6の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
E2F-6 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における E2F6 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はE2F6転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性E2F-6の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のE2F6遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるE2F-6依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびE2F6発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるE2F-6経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。